由原子构成的物质一般有金属单质、稀有气体单质、金刚石和石墨等。这些物质都是由原子直接构成的，没有由原子构成的物质是不存在的。
由原子构成的物质主要有金属和固态氢化物等，如金属汞、金属铜、金属银，以及固态的氢化物，如二氧化硅、氧化镁等。这些物质中的原子是通过离子键结合在一起的，整个物质中不存在分子或分子集团，因此这些物质通常为固态。
原子在通常状态下是以单原子的形式存在的，但在高温熔融状态下可以形成分子或原子团，进而形成分子晶体。原子晶体的特点是其中的离子键结构，这使得原子晶体一般具有熔点高、沸点高和硬度大的特点。
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由原子构成的物质在发生物理变化时，原子本身不会发生改变，但物质的状态、分子间距离和排列方式可能会发生变化。在发生化学变化时，原子间会重新组合，生成新的分子，此时原子种类和数目没有改变，原子的排列方式可能会发生变化。
例如，在加热金属时，金属原子会获得足够的能量冲破金属键的束缚成为自由电子，此时金属原子之间发生的是物理变化，没有新物质产生。但是当金属与氧气反应发生燃烧反应时，金属原子间的化学键会被打破，原子会重新组合成为新的分子，如氧化物、过氧化物等，此时产生了新的物质。
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